大多數人都曾經受過腰背痛的困擾，通常由不良姿勢、肌肉拉傷或意外引起。此外，椎間盤突出、坐骨神經痛、骨折、骨關節炎及強直性脊柱炎等結構性問題也相當常見。頸部疼痛可能由於姿勢不良、劇烈扭傷、神經壓迫或車禍引起，同時可能伴隨頸源性頭痛、肩膀及上背部疼痛，以及手臂刺痛和麻木感。

創傷性骨裂、關節退化、韌帶受傷或軟組織受傷發炎，都會引致髖關節、膝關節、足踝或足部出現疼痛及腫脹。常見問題包括前膝痛、膝關節退化、十字韌帶受傷或撕裂、足踝扭傷（俗稱拗柴）、足底筋膜炎、扁平足及腳外翻等等問題。

大部份的上肢問題常見出現於膊頭、手肘、手腕及手指，包括痛症、跟腱肌肉勞損、上肢麻痹等。原因通常由於太多重複性動作、運動受傷、拉傷、及日常和工作上錯誤的姿勢引致。常見問題包括肩周炎、肩胛肌群跟腱發炎、網球及哥爾夫球手、拇指腱鞘炎（媽媽手）和腕管綜合症。

在女性健康的範疇上，物理治療服務包括產前產後痛症、腰痛及盆骨問題、小便失禁問題及哺乳困難等。